Смотрите полный обзор и сравнение десяти видеоплееров для сайтов, использующих HTML5.

Projekktor

Поддерживает: H.264, webM, Theora Ogg, Vorbis Ogg, MP3, а так же проигрывание видео с YouTube. Рекомендую посмотреть таблицу совместимости для полного представления.

VideoJS

Не использует изображения, камтомизация полностью через CSS, бесплатный и Open Source. Поддерживает форматы: H.264, Theora Ogg, webM.

SublimeVideo

Данное решение предоставляется не виде кода, а как сервис. Вы подключаете свой сайт в панели управления, и после этого вы уже не переживаете об обновлении кода, багах и добавлении новых возможностей — сервис сам все это делает, и отдает клиенту самую последнюю версию кода.
Поддерживает: H.264, webM, Ogg. Минус: скорее всего будет платное использование, но ценовая политика пока что недоступна. Ждем старта.

FlareVideo

Открытый исходный код и бесплатное коммерческое, и частное использование. Кастомизация через HTML/CSS/JS. Требует jQuery для работы. Поддерживает: MOV, FLV, Ogg, H.264. К сожалению, не работает на iOS.

JW Player

Флеш плеер с поддержкой HTML5 от компании Long Tail. Поддерживаем такие форматы: FLV, H.264, WebM, MP3, AAC.

OSM Player

Открытый плеер, использующий HTML5. Cудя по документации, его достаточно сложно интегрировать.

LeanBack Player

Не зависит от JS фреймворков, кастомизируется через CSS, имеет поддержку субтитров и локализаций.

Kaltura

Решение, которое уже сейчас используется на Wikimedia. Поддерживает: H.264, Ogg, FLV и MOV. Использует jQuery и jQuery UI.

Uppod HTML5

Разработка отечественных конструкторов. Поддерживает: H.264, AAC, Ogg, webM. Поддержка флеш версии опционально.

jMediaElement

Основанное на jQuery и JW player решение. Позволяет использовать субтитры.

Таблица сравнения
Ниже приведена таблица сравнения рассмотренных плееров.

источник обзора — HTML5 видеоплееры